През голяма част от военната си кариера флотилен адмирал Калин Калинов е служил на подводница.

Началникът на ВВМУ „Н. Й. Вапцаров“ – флотилен адмирал проф. д-р Калин Калинов, получи награда от Съюза на подводничарите в България. Председателят на организацията – Станко Станков, заедно с членове на Управителния съвет, му връчиха специална значка и картина. Те отправиха своите поздравления към новия началник на Морско училище и отбелязаха, че флотилен адмирал Калинов винаги ще има тяхната подкрепа.

През голяма част от военната си кариера флотилен адмирал Калинов е служил на подводница. В периода 1991 – 1994 г. е командир на щурманска бойна част на подводница „Победа“, с бордови номер 81, в 8-и дивизион – „Подводници“, във Варна. Между 1994 и 1996 г. е командир на минно-торпедна бойна част на подводница в същия дивизион. От 1996 до 1998 г. е помощник-командир на подводница. След това до 2000 г. е старши помощник-командир на подводница. От 2000 до 2002 г. учи управление на оперативно-тактическите формирования във ВМС във Военната академия „Г. С. Раковски“ в София. След завръщането си е назначен за командир на подводница „Слава“, с бордови номер 84. Остава на тази позиция до 2003 г.